מסוף מטענים יוקם בבית שאן בסמוך למתחם הרכבת החדש. פתיחת המסוף היא בשורה בתחום הפיתוח הכלכלי והמסחרי: הוספת מקומות עבודה לתושבי העיר ומקור הכנסה נוספת לעירייה. בפגישה עם נציגי הרכבת ומשרד התחבורה סוכם עם ראש העיר רפאל בן שטרית, כי בשלב הראשון מתוכננות 4-5 רכבות מטען בשבוע, שייסעו בשעות הלילה, על מנת לא להפריע לתנועת רכבות הנוסעים. המסוף יפעל במשך כחמש שנים, עד השלמת המסוף הקבוע המתוכנן על שטח של כ- 40 דונם